污水处理一般来说包含以下三级处理：一级处理是它通过机械处理，如格栅、沉淀或气浮，去除污水中所含的石块、砂石和脂肪、铁离子、锰离子、油脂等。二级处理是生物处理，污水中的污染物在微生物的作用下被降解和转化为污泥。三级处理是污水的深度处理，它包括营养物的去除和通过加氯、紫外辐射或臭氧技术对污水进行消毒。可能根据处理的目标和水质的不同，有的污水处理过程并不是包含上述所有过程。
纯净水处理工艺，视原水水质而定。
如果原水是市政自来水，一般的流程是：
砂滤--活性炭过滤器--软化（可有可无）--保安过滤器--反渗透--紫外消毒--产水
如果是一般的地表水，在进入上述流程之前要杀菌并添加絮凝剂。
如果是井水，在砂滤后要加除铁锰过滤器。
在污水生化处理过程中，影响微生物活性的因素可分为基质类和环境类两大类：
基质类包括营养物质，如以碳元素为主的有机化合物即碳源物质、氮源、磷源等营养物质、以及铁、锌、锰等微量元素；另外，还包括一些有毒有害化学物质如酚类、苯类等化合物、也包括一些重金属离子如铜、镉、铅离子等。
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